1、胎儿发育环境
子宫内病毒感染是最重要的先天性心脏病原因，其中又以风疹病毒感染最为突出，其次为柯萨奇病毒感染。其他如羊膜病变、胎儿受压、妊娠早期先兆流产、母体营养不良、糖尿病，以及放射线和细胞毒性药物在妊娠早期的应用等，都是先心病的原因。
2、早产
早产是重要的先天性心脏病原因。出生时体重在2500克以下的新生儿尤易患先天性心脏病。
3、高原环境
高原氧分压低是先天性心脏病原因之一，我国青藏高原先心病患病率远较平原地区高。
4、遗传
在一个家庭中，兄弟姊妹或父母子女同时患先天性心脏病，以及不少染色体异常的遗传病同时有心脏血管畸形的事例，说明本病有遗传因素存在。
5、其他
高龄产妇(35岁以上)产下患法乐四联症、唐氏综合征婴儿的危险性较大。
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